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Text File  |  1995-03-04  |  1.3 KB  |  27 lines
  1. ********************************************************
  2. * Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase active site *
  3. ********************************************************
  4.  
  5. Glyceraldehyde  3-phosphate  dehydrogenase  (EC 1.2.1.12)  (GAPDH)  [1]  is  a
  6. tetrameric NAD-binding enzyme common to both the  glycolytic and gluconeogenic
  7. pathways. A cysteine in the middle of the  molecule  is  involved in forming a
  8. covalent  phosphoglycerol  thioester intermediate.   The sequence  around this
  9. cysteine is  totally  conserved   in  eubacterial and eukaryotic GAPDHs and is
  10. also present, albeit in a  variant  form,  in  the  otherwise highly divergent
  11. archaebacterial GAPDH [2].
  12.  
  13. -Consensus pattern: [ASV]-S-C-[NT]-T-x(2)-[LIM]
  14.                     [C is the active site residue]
  15. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL,  except
  16.  for Bacillus megaterium GAPDH which has  Pro instead of Ser in position 2  of
  17.  the pattern.
  18. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: Saccharopolyspora  erythraea  eryA,
  19.  chicken TGF beta-3 and  Streptomyces cacaoi beta-lactamase regulatory protein
  20.  blaA.
  21. -Last update: June 1994 / Text revised.
  22.  
  23. [ 1] Harris J.I., Waters M.
  24.      (In) The Enzymes (3rd edition) 13:1-50(1976).
  25. [ 2] Fabry S., Lang J., Niermann T., Vingron M., Hensel R.
  26.      Eur. J. Biochem. 179:405-413(1989).
  27.